基因组数据揭示了淋巴瘤如何致死

基因组数据揭示了淋巴瘤如何致死

哥伦比亚大学和香港科技大学研究人员的一项研究正在帮助阐明低级别淋巴瘤在发展成更具侵袭性的肿瘤时如何变化，这可能导致新疗法的开发。

研究结果发表在《自然遗传学》杂志上。

虽然通常无法治愈，但许多低级别 B 细胞淋巴瘤发展缓慢且不会危及生命。然而，在一些患者中，肿瘤会转化为更具侵袭性的淋巴瘤并构成更大的威胁。

转变为更具侵袭性的疾病被认为得到了一种称为AID的蛋白质的帮助，该蛋白质在整个B细胞基因组中产生突变。但其中许多突变的特征和后果仍然隐藏。

为了更好地了解AID如何改变基因组和转化淋巴瘤，哥伦比亚大学研究人员Rebecca Leeman-Neill博士和Uttiya Basu博士领导的团队，以及他们的科大合作者Dong Song和Jiguang Wang博士，利用了一组独特的肿瘤样本，这些患者的滤泡性淋巴瘤转变为更具侵袭性的类型，称为双打击淋巴瘤。

利用在患者疾病进展期间不同时间收集的样本，该团队能够对每个肿瘤进行全基因组测序，以追踪转化过程中产生的突变。

基因组数据显示，转化突变集中在许多基因的非编码、超增强子嵌入的启动子区域，并以意想不到的方式改变了淋巴瘤中的基因表达。

“我们预计这些区域的突变会影响通常由突变启动子控制的基因的转录，但我们也发现增强子 - 启动子相互作用被重新连接，影响其他相邻基因的表达，”Leeman-Neill说。

研究人员研究了PAX5启动子中一种特别常见的转化相关突变的后果，该突变导致增强子-启动子相互作用的重新布线，以打开ZCCHC7基因。这些变化改变了核糖体的生物发生，导致淋巴瘤细胞中蛋白质合成的广泛变化，包括DNA修复蛋白、肿瘤抑制因子和目前可用疗法靶向蛋白质的合成下降。

研究结果还表明，增强子重定向在淋巴瘤进展期间很普遍。

“这些变化可能揭示了治疗侵袭性淋巴瘤甚至防止其发展的潜在机会，”Leeman-Neill说